A proposta editorial da Annablume é viabilizar a publicação de trabalhos acadêmicos muitas vezes restritos à biblioteca da instituição onde foram produzidos. Esperamos com isso promover o debate em torno de idéias que julgamos relevantes para a sociedade contemporânea, uma vez que as dificuldades para publicação – especialmente de pesquisadores ainda inéditos – enfraquecem ainda mais a universidade brasileira: tanto o intercâmbio de reflexão entre pesquisadores como o diálogo entre essa instituição e a sociedade se tornam deficientes.

A especialização no segmento acadêmico do mercado editorial, sempre respaldada por um conselho integrado por professores das mais representativas universidades do Brasil (veja quadro abaixo), permitiu à Annablume introduzir e desenvolver um novo conceito de publicação que envolve não só a transformação da pesquisa em livro, mas também seu lançamento, divulgação e, principalmente, distribuição. Este trabalho pioneiro iniciou-se com o Selo Universidade, primeira coleção da editora e que hoje conta com mais de 380 títulos publicados.

Aos 820 títulos inéditos – quase todos de autores também inéditos – que a editora publicou desde sua criação, em 1993, somam-se três revistas: Significação (co-editada com o Núcleo de Estudos Semióticos, conceito "A" no Qualis Capes Áreas Ciência Sociais Aplicadas e Multidisciplinar), Desígnio (com o Programa de Pós-Graduação em História e Fundamentos da Arquitetura e do Urbanismo – FAU/USP conceito "A" no Qualis Áreas Arquitetura e Urbanismo e Artes e Música): Ambiente & Sociedade (com o Núcleo de Estudos e Pesquisas Ambientais – NEPAM/UNICAMP – conceito "A" no Qualis Capes Áreas Ciência Política e Relações Internacionais, Multidisciplinar e Planejamento Urbano Regional/Demografia.) e a Tensões Mundiais - Revista do Observatório das nacionalidades.

Em 2003, consolidada sua proposta editorial, a Annablume convidou seis especialistas para lançar novas coleções que contemplassem, além de novos autores, ensaios e traduções de pensadores já consagrados. São elas: “Crítica Contemporânea”, dirigida pelo professor Josué Pereira da Silva (IFCH/UNICAMP); “Comunicações”, dirigida pelo professor Norval Baitello Junior (PUC/SP); “Geografia e Adjacências”, dirigida pelo professor Antonio Carlos Robert Moraes (FFLCH/USP); “Leituras do Corpo”, dirigida pela professora Christine Greiner (PUC/SP); “História e Arqueologia em Movimento”, dirigida pelo professor Pedro Paulo A. Funari (IFCH/UNICAMP); e “Meio Ambiente e Cidadania”, dirigida pelo professor Pedro Jacobi (USP). Em 2007, a editora lançou mais uma coleção "Trabalho e Contemporaneidade", cujo conselho é composto pelos professores Jacob Carlos Lima (UFSCAR), Iram Jácome Rodrigues (USP) e José Ricardo Ramalho (UFRJ).

Várias instituições acadêmicas, como o Programa de Pós-Graduação em História da UFMG por meio da coleção "Olhares", a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo – FAPESP, a Editora da Universidade Estadual do Ceará, a Associação Nacional de Pós-Graduação e Pesquisa em Geografia – ANPEGE, o Doutorado em Literatura Comparada da UERJ, a Escola de Comunicação e Artes da USP, publicam em parceria com a Annablume.